Vlajková vznikla v hlavách dvou spolužaček Salen a Sapy v roce 2006. Historicky první Vlajková proběhla 11. října 2006. Její hráči jsou skauti z oddílů Stopař a Červánek a jejich kamarádi. Ze začátku se Vlajková koná skoro každé dva týdny, do konce roku 2006 tak probíhá ještě dvakrát.
Do organizace se rychle zapojuje turistický oddíl Cassiopeia, pod jehož hlavičkou akce probíhá. Vlajková je ze začátku velmi pestrá akce, součástí jsou někdy seznamovací hry, jindy je celá Vlajková pojatá jako soutěž městských bran pořádaná králem. Také lokace jsou různorodé: Kraví hora, Lužánky, okolí Zelného trhu. Jubilejní desátá Vlajková se odehrává v Kamenné kolonii.
Mezi lety 2006 a 2011 proběhne prvních pětadvacet Vlajkových, vše pod hlavičkou Salen a oddílu Cassiopeia. Salen ale dochází čas a síly a při oznamování Vlajkové číslo 25 uvažuje o tom, jestli nebude akce na tomhle čísle končit. Naštěstí se ale ozývá Šárka a Vlajková nachází dalšího organizátora.
Šárka nakonec po dvou Vlajkových předává v roce 2012 žezlo roverskému kmenu Kerberos, kterému organizování zůstane příštích osm let. Kerberos rozjede propagaci Vlajkové na Facebooku, začne číslování s nulou na konci, udělá nové stránky... V březnu 2017 se dokonce na Vlajkové schází 68 hráčů!
V roce 2020 Kerberos předává Vlajkovou nám, Hádesu. A my pokračujeme doteď tempem dvou až tří Vlajkových za rok. Velké změny nejsou potřeba, jenom vyměnit oranžovou vlajku za modrou, protože se plete s červenou, založit novou Zoneramu na fotky... Jinak Vlajková po všech těch letech pořád funguje a baví.